一、入学条件不同
统招本科招生对象主要是高考生和普通全日制专科应届毕业生（统招专升本）。而自考本科不受性别、年龄、民族、学历、身体健康状况、居住地等限制，凡中华人民共和国公民均可报考，但在申请毕业证时需提供专科或以上学历证书。
二、学习方式有别
统招本科需要全日制在校学习，遵循学校的教务安排完成学习任务并参加期末考试，享受全日制学习资源，教学环境和学习氛围相对较好。自考本科则学习形式灵活，考生可以根据自己的时间和学习进度自主安排学习，可选择自学、报考助学机构等方式，无需到校上课。
三、考试形式各异
统招本科的考试通常由学校出卷、评卷给学生成绩，学生需按照学校的教学计划和考试安排参加考试。自考本科部分课程由省考试院出卷、评卷给学生成绩，考生可以按照自己的学习进度选择报考的考试科目，只要所有科目成绩合格，就可以申请毕业，效率高的学生最快可以在一年半之内申请毕业。
四、毕业要求不一
统招本科只要修完所有课程并考试合格，完成毕业论文和答辩，修满规定学分即可毕业。自考本科则需要有国家承认的大专学历，考完本专业考试计划所规定的理论课程且考试成绩合格、并且完成该专业所规定的实践性环节课程考核，取得合格成绩，思想品德鉴定合格者准予毕业取得相应毕业证书。
五、学历证书性质不同
统招本科属于全日制学历，是第一学历，毕业时授予普通高等教育本科学历证书和学位证书。自考本科属于成人教育大类，是非全日制学历，是第二学历，毕业证书上写着“普通高等教育自学考试毕业证书”，除了主考院校的公章，还有自考委员会的章。
六、社会认可度有差异
统招本科的社会认可度普遍高于自考本科，在就业、考公、考研等方面，部分单位和岗位更倾向于统招本科毕业生。然而，自考本科文凭同样得到国家认可，符合条件的自考本科毕业生可以报考研究生、公务员等职位，在一些对学历要求不是特别严格的单位和岗位，自考本科也能满足需求。
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